Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCC9O60706 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ABCC9O60706 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC46.05■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
ABCC9O60706 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
ABCC9O60706 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms