Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI2O43237 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI2O43237 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI2O43237 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DYNC1LI2O43237 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DYNC1LI2O43237 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1LI2O43237 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.4 ms