Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A1O15245 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms