Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK3O14730 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK3O14730 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK3O14730 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms