Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
APAF1O14727 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APAF1O14727 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APAF1O14727 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APAF1O14727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APAF1O14727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APAF1O14727 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APAF1O14727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APAF1O14727 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APAF1O14727 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APAF1O14727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
APAF1O14727 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APAF1O14727 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
APAF1O14727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
APAF1O14727 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APAF1O14727 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APAF1O14727 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APAF1O14727 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APAF1O14727 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APAF1O14727 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APAF1O14727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
APAF1O14727 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
APAF1O14727 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APAF1O14727 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APAF1O14727 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
APAF1O14727 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APAF1O14727 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
APAF1O14727 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APAF1O14727 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APAF1O14727 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APAF1O14727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
APAF1O14727 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
APAF1O14727 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
APAF1O14727 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms