Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms