Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TISP43B9A030 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms