Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNL1A8MU46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms