Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23AA6NH52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms