Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HELTA6NFD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HELTA6NFD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms