Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRBA1A5PL33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBA1A5PL33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms