Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTAGE9A4FU28 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTAGE9A4FU28 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms