Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD3A2A2Y4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMD3A2A2Y4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms