Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRGMA1A4Y4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms