Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLRN2A0PK11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLRN2A0PK11 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms