Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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