Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185 ms