Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP1Q9C000 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms