Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAPERQ9BY12 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms