Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LNX2Q8N448 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms