Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms