Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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