Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms