Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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