Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRIP12Q14669 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TRIP12Q14669 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TRIP12Q14669 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP12Q14669 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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