Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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