Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAD23AP54725 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAD23AP54725 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAD23AP54725 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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RAD23AP54725 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAD23AP54725 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAD23AP54725 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAD23AP54725 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAD23AP54725 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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