Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NESP48681 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NESP48681 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NESP48681 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NESP48681 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms