Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms