Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFNP31947 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFNP31947 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFNP31947 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms