Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRCP23327 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRCP23327 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms