Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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