Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB5A4FU69 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms