Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERVK-18Q9QC07 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVK-18Q9QC07 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms