Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A4GALTQ9NPC4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms