Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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