Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms