Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FRMPD1Q5SYB0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms