Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FHOD3Q2V2M9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHOD3Q2V2M9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms