Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms