Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ZFHX3Q15911 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ZFHX3Q15911 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ZFHX3Q15911 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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