Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IHHQ14623 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IHHQ14623 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IHHQ14623 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms