Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms