Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEX3Q00994 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms