Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PITX1P78337 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX1P78337 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms