Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPN5P54829 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN5P54829 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN5P54829 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms