Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC3P51654 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms