Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms