Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms