Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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